admin管理员组

文章数量:1566999

2024年5月18日发(作者：)

浅谈生物信息学在生物方面的应用

生物信息学（bioinformaLics）是以核酸和蛋白质等生物大分子数据库及其相关的图

书、文献、资料为主要对象，以数学、信息学、计算机科学为主要手段，对浩如烟海的原

始数据和原始资料进行存储、管理、注释、加工，使之成为具有明确生物意义的生物信息。

并通过对生物信息的查询、搜索、比较、分析，从中获得基因的编码、凋控、遗传、突变

等知识；研究核酸和蛋白质等生物大分子的结构、功能及其相互关系；研究它们在生物体

内的物质代谢、能量转移、信息传导等生命活动中的作用机制。

从生物信息学研究的具体内容上看，生物信息学可以用于序列分类、相似性搜索、DNA

序列编码区识别、分子结构与功能预测、进化过程的构建等方面的计算工具已成为变态反

应研究工作的重要组成部分。针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找过敏原基因，找

出基因的位置和功能位点的位置，以及标记已知的序列模式等过程。针对蛋白质序列的分

析，可以预测出蛋白质的许多物理特性，包括等电点分子量、酶切特性、疏水性、电荷分

布等以及蛋白质二级结构预测，三维结构预测等。

生物信息学中的主要方法有：序列比对，结构比对，蛋白质结构的预测，构造分子进

化树，聚类等。 基因芯片是基因表达谱数据的重要来源。目前生物信息学在基因芯片中的

应用主要体现在三个方面。

1、确定芯片检测目标。利用生物信息学方法，查询生物分子信息数据库，取得相应的

序列数据，通过序列比对，找出特征序列，作为芯片设计的参照序列。

2、芯片设计。主要包括两个方面，即探针的设计和探针在芯片上的布局，必须根据具

体的芯片功能、芯片制备技术采用不同的设计方法。

3、实验数据管理与分析。 对基因芯片杂交图像处理，给出实验结果，并运用生物信

息学方法对实验进行可靠性分析，得到基因序列变异结果或基因表达分析结果。尽可能将

实验结果及分析结果存放在数据库中，将基因芯片数据与公共数据库进行链接，利用数据

挖掘方法，揭示各种数据之间的关系。

生物信息学在人类基因组计划中也具有重要的作用。

大规模测序是基因组研究的最基本任务，它的每一个环节都与信息分析紧密相关。目

前，从测序仪的光密度采样与分析、碱基读出、载体标识与去除、拼接与组装、填补序列

间隙，到重复序列标识、读框预测和基因标注的每一步都是紧密依赖基因组信息学的软件

和数据库的。特别是拼接和填补序列间隙更需要把实验设计和信息分析时刻联系在一起．拼

接与组装中的难点是处理重复序列，这在含有约30％重复序列的人类基因组中显得尤其突

出。

人类基因组的工作草图即将完成，因此发现新基因就成了当务之急。使用基因组信息

学的方法通过超大规模计算是发现新基因的重要手段，可以说大部分新基因是靠理论方法

预测出来的。比如啤酒酵母完整基因组（约1300万bp）所包含6千多个基因，大约60％

是通过信息分析得到的。

当人类基因找到之后，自然要解决的问题是：不同人种间基因有什么差别；正常人和

病人基因又有什么差别。”这就是通常所说的SNPs（单核苷酸多态性）。构建SNPs及其

相关数据库是基因组研究走向应用的重要步骤。1998年国际已开展了以EST为主发现新

Spps的研究。在我国开展中华民族SNPs研究也是至重要的。 总之，生物信息学不仅将

赋予人们各种基础研究的重要成果，也会带来巨大的经济效益和社会效益。在未来的几年

中DNA序列数据将以意想不到的速度增长，这更离不开利用生物信息学进行各类数据的

本文标签： 生物序列信息学基因分析

版权声明：本文标题：浅谈生物信息学在生物方面的应用 内容由热心网友自发贡献，该文观点仅代表作者本人， 转载请联系作者并注明出处：https://www.elefans.com/dongtai/1715993555a480656.html， 本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容，一经查实，本站将立刻删除。