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2024年7月4日发(作者：)
NCBI在线BLAST使用方法与结果详解
NCBI（National Center for Biotechnology Information）是一个包含大
量基因组学、生物信息学等相关数据和工具的数据库。其中，BLAST
（Basic Local Alignment Search Tool）是一种常用的序列比对工具，可
用于在数据库中搜索相似序列。
一、BLAST简介
BLAST是一种基于序列比对的方法，可用于确定一给定序列与数
据库中序列的相似性。其工作原理是将查询序列与数据库中的序列进
行比对，并生成一个比对得分来衡量它们之间的相似程度。通过
BLAST的结果，可以获得序列的匹配位置、长度、相似性等信息，从
而帮助研究人员进行更深入的生物学研究。
二、使用方法
1. 打开NCBI网站
首先，打开浏览器，输入NCBI的网址
（/），进入NCBI的官方网站。
2. 进入BLAST页面
在NCBI的主页上，找到“BLAST”或“BLAST and Alignments”选项，
并点击进入BLAST页面。
3. 输入查询序列
在BLAST页面上，找到“Enter Query Sequence”或“Enter accession
number, gi, or FASTA sequence”等文本框，将需要查询的序列输入其中。
可以直接复制粘贴序列，或选择上传文件的方式输入。
4. 选择数据库
在BLAST页面上，找到“Choose Search Set”或“Database”等选项，
选择需要比对的数据库。NCBI提供了多个数据库，如“nr”（非冗余蛋
白数据库）、“nt”（非冗余核酸数据库）等，根据研究需要选择合适的
数据库。
5. 设置参数
根据需要，可以通过“Algorithm parameters”等选项来设置比对参数，
如设置匹配的阈值、比对的方式等。
6. 运行BLAST
设置完成后，点击“BLAST”或“Run BLAST”等按钮运行BLAST。
系统将开始进行序列比对的计算，并在完成后显示结果。
三、结果解析
BLAST的结果通常包括序列比对的统计信息、匹配的序列以及其
他相关数据。
1. 统计信息
BLAST结果的第一部分是关于查询序列的统计信息，如查询的长
度、相似度等。
2. 匹配序列列表
接下来是匹配到的序列列表，按相似性排序。对于每个匹配序列，
结果会展示匹配的得分、匹配的长度、匹配的位置等信息。
3. 序列比对视图
BLAST还提供了序列比对的可视化视图，用于直观显示查询序列
与匹配序列的匹配情况。这个视图可以帮助用户更好地理解序列之间
的相似性。
4. 其他数据和工具
BLAST结果页面通常还包含一些其他的数据和工具，如关于匹配
序列的详细信息、序列的注释信息等。用户可以根据需要进一步探索
和分析这些数据。
四、结果解释和应用
通过BLAST获得的结果可以用于多种研究和应用中。以下是一些
常见的应用场景：
1. 序列同源性分析
BLAST可以帮助研究人员分析序列之间的同源性，即判断给定序
列是否有与其他序列相似的亲缘关系。通过对比分析得到的BLAST结
果，可以推断序列的进化关系、相同功能区域等。
2. 新序列注释
当研究人员获得一个未知序列时，BLAST可以帮助他们对该序列
进行注释。通过比对查询序列与数据库中已知序列的相似性，可以初
步预测未知序列的功能、结构等特征。
3. 异源基因鉴定
在基因组学研究中，研究人员经常需要鉴定某个基因是否存在于待
测样本中。BLAST可用于将待测样本的序列与已知的相关基因序列进
行比对，从而判断待测样本中是否存在该基因。
4. SNP鉴定
BLAST还可用于鉴定及分析SNP（Single Nucleotide Polymorphism）
变异。通过比对待测样本与已知序列，可以发现并分析其中的SNP位
点，从而为个体差异研究提供基础数据。
总结：
NCBI在线BLAST是一款功能强大的生物信息学工具，可以帮助研
究人员进行序列比对和相似性分析。通过BLAST，我们可以获得详细
的序列匹配信息，从而进行序列同源性分析、注释未知序列、鉴定基
因和分析SNP等应用。熟练掌握NCBI在线BLAST的使用方法和结果
解析，对于生物信息学研究具有重要意义。
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