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文章目录

  • 现有的DDI预测方法?
      • 1 similarity-based:(**假设化学结构相似的药物具有相似的DDI**)
      • 2 graph-based:
      • 3 其他方法:
  • 一些关于DDS的论文?
  • AI医药方向的综述?

(提醒:本文模型图只是放了缩略图让大家了解个大概,建议还是看原论文中的模型图。)

现有的DDI预测方法?

DDI预测方法主要分为两类:基于药物结构特征相似性的方法和基于的方法。

1 similarity-based:(假设化学结构相似的药物具有相似的DDI

  • **DeepDDI模型

    Deep learning improves prediction of drug–drug and drug–food interactions.

    Proceedings of the National Academy of Sciences,2018

    这是第一个将深度学习应用于药物预测的模型。利用药物的SMILES数据生成药物对的结构相似性剖面(SSP),然后通过PCA降维将其送入深度神经网络(DNN)进行分类

  • DeepDDI模型优化1

Novel deep learning model for more accurate prediction of drug-drug interaction effects

BMC Bioinformatics,2019

在DeepDDI的基础上添加了两个新数据,其方法类似于药物SMILES数据生成的SSP:目标基因数据生成TSP(目标相似性档案)和基因本体(GO)生成GSP(基因本体术语相似性档案)。这三个特征向量通过一个改进的编码器进行降维,然后连接成一个单一的药物对特征向量,放入DNN进行训练。改进后的模型数据量大,精度高。

  • DeepDDI模型优化2

A multimodal deep learning framework for predictingdrug–drug interaction events

Bioinformatics,2020

在DeepDDI的基础上提出了一个多态性深度学习模型,该模型使用筛选的完整信息进行训练。它可以利用与多种药物相关的信息进行更有效的学习,具有更高的准确性。基于药物特征的方法在已知数据集上具有较高的准确性,但也存在一定的局限性。

  • DDI

本文标签: 药物方向重点医药论文