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2024年3月31日发(作者:)

小木虫 Diamond 软件问题集锦

1. Diamond出图时怎么设置dpi数目

我在使用Diamond出图时分辨率并不算小,可是编辑说我的图只有 96dpi,但杂志要

求 至少 600dpi,请问我该怎么设置? 答: 在/对话框的Targets中选择

Bitmap,然后就可以自己输入需要的分辨 率了.要保存为位图格式才可以.如果是JPG格式,

还是 96dpi. 答: 呵呵,发现在 tools 下拉菜单的 option 里.

2. Diamond椭球图阴影画图 如图中所示,怎么画出每个椭球中的阴影部分?我用的是

3.1d版本.

答 : 这 个 是 在 diamond 中 的 ' 原 子 设 置 中 ' 中 选 的 , 具 体 如 下 :

picture-------atoms design-------style and colors-------style 中选择 octant 即可.

3.怎样建立氢键 我这儿有一个 cif 文件,一个 tab 文件和两个已经用 diamond 作

好的图,但不知道这两 个图是怎么画出来的,想知道作图过程,请 diamond 高手用 word

或 pdf 写出作图过程.

答:没什么技术含量的吧,堆积一下,删掉多余的原子,创建氢键就好.

4.怎样建立单个分子

diamond 一打开 cif,就是堆积图,怎么才能显示一个分子.

答:好像最新的更新包已经改过这个 bug 了.但是因为没有对应的破解程序,所以俺还

是用以前的 3.0,经常遇到这个问题.如果你的分子间没有作用,即:没有乱七八糟的 键连在

一起,选中一个原子,然后,ctrol+M, 选中一个分子,然后,反选,即选中除该 分子之外的所有

分子,然后一键 delete, 就 ok 了.如果分子连成片,就删吧. 对于非中心分子,即含反离子的

分子结构要小心,不要把反离子漏掉了.当然,如果不 用画就没问题了.以上拙见,仅供参考.

答:diamond 打开 cif 时选"建立单个分子",然后点完成,不要点下一步. 请教diamond画

C60 遇到的问题 (1)我这个 C60 在画多面体的时候,中间 inset 的 atom 的半径 在每

个面上都要自己 一个一个去设定 radium,有没有同类原子半径一起设置的?里面没有找到.

(2)当我把中间的 dummy 原子(就是为了画多面体的时候新加入的)的半径设为 0 后,如

果想改 C60 的每个面的颜色的画,这个怎么改的? (3)最后问一下,我保存的图片中背景

的 diamond demonstrator 如何去掉. 另献上我第一幅 diamond 图,如下. 6. 7. 答:1.

可以在 atom 设置里找到假原子直接设置 2. 以假原子为中心画多面体 3. 你用的 应该

是未破解版本. diamond中如何在螺旋链中插入一根棒 diamond 中如何在螺旋链中插

入一根棒,以及如何看结构是单螺旋还是双螺旋结构,如 何画出单,双螺旋结构? 答:插入几

个哑原子,然后连键,进行一些设置就可以了.前段时间有人传了一些 Diamond 的说明,其

中有一个文件就是详细说明这个棒怎么画的. 找到了这个文件,感谢原作者 Crystalsnet,我

把它上传到纳米盘,你自己下载下来看看 就知道怎么做了. 答:在孔道两侧虚拟两个原子,然

后在这两个原子间成建,设置一下键参数就可以了! 答:具体说,选择两端的几个院子,再找这

几个的中心位置,分别 insert atoms , 再 连 接心连接, insert bond, 在按你的意思 edit

the bond. 如何去掉 M-C,M-H 连接 打开一个晶体数据后,在 connectivity 中把

M-C,M-H 去掉后.再点 complete fragments 第 3 页 共 13 页

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