admin管理员组文章数量:1600155
2021年nanopore第12期培训班（线上）开始报名。本期主题为“nanopore测序基因组拼接数据分析”。nanopore测序实时，快速，便携，长度长，高通量等诸多特点，特别适合微生物研究。在新冠病毒研究以及后续病毒溯源方面都会有重要的应用。本次培训班，我们将系统介绍纳米孔测序在基因组拼接中的应用，并新增两章新冠病毒数据分析专题。通过本次培训班你将完成以下五大主题：1、熟悉纳米孔测序；2、配置数据分析工作环境；3、纳米孔测序基因组拼接；4、新冠病毒数据分析；5、基因组序列分析。
课程特色
1、内容丰富，循序渐进，从零基础开始学习；
2、以完整项目为案例，提供超高配置服务器亲自上手操作，快速掌握技能；
3、线上教学，可以周末在家中学习，提供录屏，可供回看；
4、130多页讲义，400多张PPT，600多行案例代码提供丰富学习材料。
主讲老师
王通
曾任职于华大基因，12年以上生物信息分析经验，擅长基因组拼接，处理过细菌，真菌，宏基因组，动植物，病毒，RNAseq等各种物种基因组拼接，处理过illumina，454，pacbio等测序技术数据。nanopore测序技术专家，阅读nanopore相关文献百余篇，撰写nanopore测序技术数据分析中文专栏，已完成nanopore培训11期。曾任华大基因高级讲师。2015年开始创业，主要做生物信息培训工作。国内最早生物信息教学视频制作者，已制作视频600集以上。目前已在北京、上海、广州、深圳、哈尔滨、杭州、武汉、南京、长春、青岛、重庆、海口等组织42场培训班，培训经验丰富，线上线下累计学员超过6000多名。公众号“基因学苑”作者，已写作生物信息教程800多篇。
课程安排
（根据教学进度现场情况适当调整进度）
时间 | 主题 | 课程安排 |
第一天（上午） | 课程介绍 | 一、纳米孔测序技术简介 纳米孔测序技术介绍 纳米孔测序的应用 测序原理 不同测序平台比较 纳米孔测序的错误问题 二、熟悉Linux系统 登录Linux系统 传输文件 Linux基本操作 |
第一天（下午） | 安装软件 | 目录结构 编写脚本 三、利用bioconda管理生物软件 安装bioconda 纳米孔测序分析软件安装 下载练习数据 |
第二天（上午） | 纳米孔数据处理 | 四、纳米孔数据处理 fast5文件格式 利用guppy进行basecalling 拆分barcode 利用nanopplot进行数据质控 利用filtlong进行数据过滤 测序数据可视化 五、纳米孔基因组拼接 纳米孔测序基因组拼接原理 常用nanopore数据拼接软件 小基因组拼接 |
第二天（下午） | 纳米孔基因组拼接 | 动植物基因组拼接 六、拼接结果统计及评估 拼接结果统计 N50 quast组装结果评估 BUSCO评估 不同数据混合拼接 illumina测序数据拼接 方案几种拼接方案的比较 不同条件对拼接结果的影响
七、拼接结果优化 组装结果优化原理 medaka组装结果纠错 pilon组装结果纠错 racon组装结果纠错
|
第三天（上午） | 新冠病毒数据分析 | 八、拼接新冠病毒基因组 拼接新冠病毒参考序列 病毒序列富集 病毒基因组拼接原理 一致性序列得到病毒基因组 ARTICNetwork工作流程
九、新冠病毒基因组分析 聚类分析 变异检测 构建系统发育树 变种病毒识别 |
第三天（下午） | 拼接结果优化及分析 | 十、序列分析 基因预测 基因功能注释 ncRNA分析 重复序列分析 结果统计 在线分析 |
报名须知
培训时间：2021年7月23日~25日 （每天上午9:00-下午5:00）
培训费用：4900元
上课方式：腾讯会议直播
付款方式
付款方式：银行对公转账
户 名：青岛同源基因科技有限责任公司
开户银行：中国建设银行青岛高新区支行
账户：37101006101052502221
也可以公务卡微信支付宝扫码支付等，会议通知等请联系工作人员。
报名方式
扫描下方二维码，添加微信报名，备注nano
常见问题
1、零基础是否可以学会？
完全没有问题，我们本次培训班会从零开始，一步步带领大家逐步熟悉nanopore测序相关的原理以及具体操作。不要害怕自己是零基础，如果不学习，永远都是零基础。
2、对计算机有要求吗？
对计算机要求不高，因为我们主要分析部分都是通过远程服务器来完成的，我们会给每个用户一个账户密码，远程登录到我们2T内存的服务器上，2T内存可以让每个用户都现场完成分析。如果有条件，我建议准备两个屏幕，一个评估观看直播，一个同步操作，这样最好。
3、Mac电脑是否可以？
苹果电脑完全没有问题，也可以远程登录服务器和传输文件，不过我们课程介绍的最后一个组间统计检验的软件stamp，该软件本身对mac系统支持不好，所以，这个软件可能用不了，其他的都没问题，不过根据我的经验，windows系统可能更方便一下，当然这个也看个人习惯。
4、如何付款？
可以对公转账，也可以支付宝微信转账。
5、上完课就能够自己做分析了吗？
可以，如果你现在手里就有纳米孔测序的数据，或者即将开始要测序，我们课上会介绍完整纳米孔数据分析流程，也都会给出案例代码，回去之后，只需要会修改文件名部分，就可以自己完成分析。
6、可以开发票吗？
可以，具体开票内容可以填写到报名回执清单里，开票内容可以在里面进行勾选。
7、需要做哪些准备？
因为我们培训以实际操作为主，有很多操作部分，这些操作都是敲代码完成，所以，最好提前熟悉Linux操作，我们会提前发送一下这方面的学习资料，希望大家提前预习，上课也会详细介绍，如果提前预习，效果会更好。
8、视频可以回看吗？
可以，直播的内容，我们会分段剪辑，然后发给大家，大家可以继续巩固学习。
最后，欢迎大家报名参加我们本次培训班。
9、课程具体时间安排？
每天上午9点正式开始，5点半结束，具体上午9点至中午12点，下午1点半至5点，然后答疑时间，平均每1小时休息10分钟答疑时间。
版权声明：本文标题：nanopore测序第12期培训班（含新冠病毒分析）开始报名 内容由热心网友自发贡献，该文观点仅代表作者本人， 转载请联系作者并注明出处：https://www.elefans.com/xitong/1728337833a1154916.html， 本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容，一经查实，本站将立刻删除。
发表评论