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2024年5月16日发(作者：)

【资源】miRNA数据库及靶基因分析软件

miRNA数据库及靶基因分析软件

e:

miRBase序列数据库是一个提供包括已发表的miRNA序列数据、注释、预测基因靶

标等信息的全方位数据库，是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase提供

便捷的网上查询服务，允许用户使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息。

rds:

动物 mirna的靶相互作用的数据库, 包括人工收集实验验证的, 预测的 miRNA的靶

目标. 靶标预测工具DIANA-microT, MicroInspector, miRanda, MirTarget2, miTarget,

NBmiRTar, PicTar, PITA, RNA22, RNAhybrid, and TargetScan/TargertScanS.

:

PMRD是一个关于植物microRNA数据库，包括了microRNA序列和它们的靶基因、

二级结构、表达谱、基因组搜索等等，并且该数据库尝试着整合大量的关于植物microRNA

的数据。

R:

CoGeMiR数据库总结关于在进化过程中microRNA在不同动物中的保守性。该数据

库搜集已知的和预测的microRNA关于染色体定位、保守性和表达谱方面的信息。

NAdb:

MicroRNAdb是一个关于microRNA的综合性数据库。相比其他数据库，

MicroRNAdb搜集的microRNA更完整且进行了充分的注释。如今，该数据库有732个

microRNA序列的条目和439个详细的注释。

k:

miRWalkis是一个综合性数据库，提供来自人类、小鼠和大鼠的miRNA的预测信息

和经过验证的位于其靶基因上的结位点。

e:

TarBase数据库人工搜集了实验验证过的miRNA的靶基因，包括在人、小鼠、果蝇、

蠕虫和斑马鱼中的miRNA的靶基因，区分出这些miRNA靶基因中的对的和不对的。

or:

miRGator数据库是一个引导对miRNA进行功能阐释的工具。功能分析和表达谱结合

靶基因预测，可以对miRNA的生物学功能进行推测。

:

miRGen是一个整合型数据库,包括：(i)动物miRNA和基因组元件之间的位置关系;(ii)

本文标签： 数据库基因预测

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