admin管理员组

文章数量:1597400

软件：meme-suit

用途：鉴定motif

目的：其实我这里主要是为了使用streme模块(因为sequence number超过50)。

办法：

1. 如果只安装meme，可以直接用conda install -c bioconda meme。

2. 如果需要所有的套件，需要手动安装：

准备好gcc 和 make

下载meme

安装

整个过程很简单，本章只讲安装，安装实际尝试顺序讲，下一章讲使用。

最后的整个过程会被去掉报错部分，调整为最直接的方案，系统整理到微信公众号：生物信息分析学习 中。

详细步骤如下：

$ wget http://meme-suite/meme-software/5.3.0/meme-5.3.0.tar.gz

$ tar zxvf meme-5.3.0.tar.gz

$ ./configure --prefix=/Yuan/app/meme --with-url="http://meme-suite"

出现报错：

$ ./configure --prefix=/Yuan/app/meme --with-url="http://meme-suite"

checking for a BSD-compatible install... /usr/bin/install -c

checking whether build environment is sane... yes

checking for a thread-safe mkdir -p... /bin/mkdir -p

checking for gawk... gawk

checking whether make sets $(MAKE)... no

checking whether make supports nested variables... no

checking whether make supports nested variables... (cached) no

checking for gcc... no

checking for cc... no

checking for cl.exe... no

configure: error: in `/Yuan/soft/meme-5.3.0':

configure: error: no acceptable C compiler found in $PATH

See `config.log' for more details

原因：全新的集群，没有gcc什么的，需要安装一下。

但是，既然万物皆可conda，看看：

果然有，直接安装：

$conda install -c bioconda meme

$ which meme

/Yuan/app/anaconda3/bin/meme

安装完成。

那我一定要编译呢？

$ gcc

Command 'gcc' not found, but can be installed with:

apt install gcc

$ apt install gcc

继续报错：

$ apt install gcc

Reading package lists... Done

Building

本文标签： 从零开始学生软件LinuxMEME

版权声明：本文标题：linux下使用MEME软件,从零开始学生信-meme的安装和使用 内容由热心网友自发贡献，该文观点仅代表作者本人， 转载请联系作者并注明出处：https://www.elefans.com/dianzi/1728282292a1151937.html， 本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容，一经查实，本站将立刻删除。