admin管理员组文章数量:1566353
生信环境搭建
WSL2与Miniconda3
- 生信环境搭建
- 前言
- 一、下载WSL2
- 二、安装Miniconda3
- 三、安装Anaconda
- 总结
前言
生物信息学需要处理大量数据，然而在Windows系统下有些操作显得尤为复杂。例如，从NCBI中下载大量序列文件，在Windows系统下可能需要一个接着一个的下载（也许可以用爬虫爬取），这样就过于浪费时间。Linux系统下进行批量下载尤为容易
对于Windows用户，进行Linux系统的操作有三种选择，第一是Linux子系统WSL2；第二是虚拟机，例如VM；第三是双系统；这里推荐Linux子系统。
WSL全称Windows Subsystem for Linux，即Windows下的Linux子系统。
一、下载WSL2
1.首先了解你的电脑版本，找到适用你电脑的wsl版本。
2.你需要打开控制面板
3.打开“程序”
4.选择启用或关闭Windows功能，并打开“适用于Linux的Windows子系统”，最好关机重启一次
5.用管理员身份打开Windows PowerShell输入下列代码：
dism.exe /online /enable-feature /featurename:VirtualMachinePlatform /all /norestart
6.打开Microsoft下载相应的Ubuntu
我第一次下载的是第二个版本，但是老是打不开，显示wsl --shutdown。
下载第一个之后能打开，但是出现了0x800701bc Error: 0x800701bc WSL 2 ???
在网上搜索一番后发现是内核没有升级。可以通过以下链接下载升级文件。然后重启电脑（这里参考了华墨1024写的文章）
下载升级文件地址：https://wslstorestorage.blob.core.windows/wslblob/wsl_update_x64.msi
之后就可以正常使用啦！
如果使用Microsoft store安装ubuntu出错或者下载不了，可以使用管理员身份运行powershell，输入：
wsl --install -d ubuntu
下载终端
二、安装Miniconda3
打开wsl2，输入以下命令：
wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
下载完成后，给予权限：
chmod 777 Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
而后运行软件：
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
而后激活conda，如果遇到conda: command not found
原因是~/.bashrc文件没有配置好。
输入
vim ~/.bashrc
然后在最后一行输入,YOUR_NAME是你的用户名
export PATH=$PATH:/home/YOUR_NAME/miniconda3/bin
而后激活miniconda3就可以啦
三、安装Anaconda
anaconda的安装和Miniconda的安装非常相似。
anaconda_Linux64位版本，输入以下命令即可下载
wget https://repo.anaconda/archive/Anaconda3-2021.04-Linux-x86_64.sh
其他版本可以点击这里进行查询
总结
以上就是关于wsl2以及miniconda3的安装啦！如果解决了你的问题可以留下赞再走哦！
版权声明：本文标题：windows系统下装载wsl2，安装Miniconda3或Anaconda进行生信准备工作 内容由热心网友自发贡献，该文观点仅代表作者本人， 转载请联系作者并注明出处：https://www.elefans.com/dianzi/1727555273a1120868.html， 本站仅提供信息存储空间服务，不拥有所有权，不承担相关法律责任。如发现本站有涉嫌抄袭侵权/违法违规的内容，一经查实，本站将立刻删除。
发表评论