从常规的前pression选择数字

本文介绍了从常规的前pression选择数字的处理方法，对大家解决问题具有一定的参考价值，需要的朋友们下面随着小编来一起学习吧！ 问题描述

我有数据设置如下：

引用：HBOND摘要输出到文件HB_lowLyo_D_lipid_A_water_001_064.tbl，数据排序，内残留的相互作用不包括在内，距离截止是4.00埃，角度截止是120.00度对于倾倒入住率和GT氢键的信息; 0.00DONOR ACCEPTORH ACCEPTOR原子＃@水库原子一个原子＃@ RES原子一个原子＃@ RES原子％占据角距离| 4645 58 @ O12 | 23489 1174 // @ H1 23488 1174 // @Ô| 22.79 2.945（0.28）26.79（14.41）| 4645 58 @ O12 | 23490 1174 // @ H2 23488 1174 // @Ô| 22.49 2.965（0.31）28.01（14.47）| 2701 34 @ O12 | 23333 1122 // @ H1 23332 1122 // @Ô| 20.60 2.965（0.23）30.07（14.18）| 2701 34 @ O12 | 23334 1122 // @ H2 23332 1122 // @Ô| 19.74 2.963（0.23）31.43（13.88）| 271 4 @ O12 | 23334 1122 // @ H2 23332 1122 // @Ô| 19.70 2.825（0.19）21.92（12.15）| 271 4 @ O12 | 23333 1122 // @ H1 23332 1122 // @Ô| 19.55 2.826（0.19）22.22（12.71）| 4655 58 @ O16 | 21156 396 @ H2 21154 396 @Ô| 19.43 2.933（0.22）31.95（15.18）| 4658 58 @ O15 | 21156 396 @ H2 21154 396 @Ô| 18.96 3.163（0.27）37.03（14.63）| 4310 54 @ O26 | 23202 1078 // @ H2 23200 1078 // @Ô| 18.73 2.821（0.24）25.87（13.92）| 4655 58 @ O16 | 21155 396 @ H1 21154 396 @Ô| 18.63 2.917（0.22）31.91（15​​.​​00）| 1820 23 @ O16 | 21167 400 @ H1 21166 400 @Ô| 18.14 2.910（0.22）27.20（13.87）| 1820 23 @ O16 | 21168 400 @ H2 21166 400 @Ô| 17.96 2.907（0.21）26.69（13.86）| 3845 48 @ O16 | 23454 1162 // @ H2 23452 1162 // @Ô| 17.68 2.991（0.31）28.45（14.88）| 4658 58 @ O15 | 21155 396 @ H1 21154 396 @Ô| 17.31 3.177（0.27）38.82（14.69）| 3845 48 @ O16 | 23453 1162 // @ H1 23452 1162 // @Ô| 17.29 3.016（0.32）28.84（14.57）| 1489 @ 19 O13 | 23201 1078 // @ H1 23200 1078 // @Ô| 16.66 2.884（0.23）31.39（15.56）| 3824 48 @ O26 | 21099 377 @ H2 21097 377 @Ô| 15.44 2.992（0.30）30.78（15.01）| 4253 53 @ O15 | 23454 1162 // @ H2 23452 1162 // @Ô| 14.98 2.961（0.27）33.71（15.​​09）| 1459 @ 19 O22 | 23201 1078 // @ H1 23200 1078 // @Ô| 14.84 3.012（0.33）35.08（16.12）| 1081 14 @ O12 | 21173 402 @ H1 21172 402 @Ô| 14.76 2.937（0.24）27.54（14.26）| 4253 53 @ O15 | 23453 1162 // @ H1 23452 1162 // @Ô| 14.63 2.955（0.25）33.68（15.11）| 1081 14 @ O12 | 21174 402 @ H2 21172 402 @Ô| 14.41 2.944（0.25）28.34（14.35）| 3824 48 @ O26 | 21098 377 @ H1 21097 377 @Ô| 13.70 3.002（0.30）31.00（15.21）| 3845 48 @ O16 | 21156 396 @ H2 21154 396 @Ô| 13.06 2.934（0.26）27.71（14.05）。。。

有总共约40,000线。

我想选择的条件第3，并在1-64之间的范围内第6场秋季数字的@符号之前。

线

我曾尝试与AWK像这样code

的awk'$ 3〜/ ^ [0-9] /＆放大器;＆安培; $ 6〜/ ^ [0-9] / {}打印hhHB_LL1000_D_lipid_A_water_001_064.tbl |头

解决方案

如果我正确跨preT您的输入，这些都是应落在区间[1-64]中的字段：

| 4645 58 @ O12 | 23489 1174 // @ H1 23488 1174 // @Ô| 22.79 2.945（0.28）26.79（14.41）       ^^_______ | ______ |

据我所知，没有什么你，你已经张贴输入有这种行为...

使用以下awk脚本：

/ ^ | / {    拆分（$ 3，@）    拆分（$ 6，B，@）    如果（一个[1]≥= 1和;＆放大器;一个[1] = 64＆放大器;和b [1]≥= 1和;和b [1] = 64）打印}

如果我加一条线，你输入：

| 3845 48 @ O16 | 21156 39 @ H2 21154 396 @Ô| 13.06 2.934（0.26）27.71（14.05）       ^^_______ | ______ |

本脚本输出：

$ AWK -f digits.awk digits.txt| 3845 48 @ O16 | 21156 39 @ H2 21154 396 @Ô| 13.06 2.934（0.26）27.71（14.05）

I have data set as below:

Quote: HBOND SUMMARY output to file HB_lowLyo_D_lipid_A_water_001_064.tbl, data was sorted, intra-residue interactions are NOT included, Distance cutoff is 4.00 angstroms, angle cutoff is 120.00 degrees Hydrogen bond information dumped for occupancies > 0.00 DONOR ACCEPTORH ACCEPTOR atom# res@atom atom# res@atom atom# res@atom %occupied distance angle | 4645 58@O12 | 23489 1174@H1 23488 1174@O | 22.79 2.945 ( 0.28) 26.79 (14.41) | 4645 58@O12 | 23490 1174@H2 23488 1174@O | 22.49 2.965 ( 0.31) 28.01 (14.47) | 2701 34@O12 | 23333 1122@H1 23332 1122@O | 20.60 2.965 ( 0.23) 30.07 (14.18) | 2701 34@O12 | 23334 1122@H2 23332 1122@O | 19.74 2.963 ( 0.23) 31.43 (13.88) | 271 4@O12 | 23334 1122@H2 23332 1122@O | 19.70 2.825 ( 0.19) 21.92 (12.15) | 271 4@O12 | 23333 1122@H1 23332 1122@O | 19.55 2.826 ( 0.19) 22.22 (12.71) | 4655 58@O16 | 21156 396@H2 21154 396@O | 19.43 2.933 ( 0.22) 31.95 (15.18) | 4658 58@O15 | 21156 396@H2 21154 396@O | 18.96 3.163 ( 0.27) 37.03 (14.63) | 4310 54@O26 | 23202 1078@H2 23200 1078@O | 18.73 2.821 ( 0.24) 25.87 (13.92) | 4655 58@O16 | 21155 396@H1 21154 396@O | 18.63 2.917 ( 0.22) 31.91 (15.00) | 1820 23@O16 | 21167 400@H1 21166 400@O | 18.14 2.910 ( 0.22) 27.20 (13.87) | 1820 23@O16 | 21168 400@H2 21166 400@O | 17.96 2.907 ( 0.21) 26.69 (13.86) | 3845 48@O16 | 23454 1162@H2 23452 1162@O | 17.68 2.991 ( 0.31) 28.45 (14.88) | 4658 58@O15 | 21155 396@H1 21154 396@O | 17.31 3.177 ( 0.27) 38.82 (14.69) | 3845 48@O16 | 23453 1162@H1 23452 1162@O | 17.29 3.016 ( 0.32) 28.84 (14.57) | 1489 19@O13 | 23201 1078@H1 23200 1078@O | 16.66 2.884 ( 0.23) 31.39 (15.56) | 3824 48@O26 | 21099 377@H2 21097 377@O | 15.44 2.992 ( 0.30) 30.78 (15.01) | 4253 53@O15 | 23454 1162@H2 23452 1162@O | 14.98 2.961 ( 0.27) 33.71 (15.09) | 1459 19@O22 | 23201 1078@H1 23200 1078@O | 14.84 3.012 ( 0.33) 35.08 (16.12) | 1081 14@O12 | 21173 402@H1 21172 402@O | 14.76 2.937 ( 0.24) 27.54 (14.26) | 4253 53@O15 | 23453 1162@H1 23452 1162@O | 14.63 2.955 ( 0.25) 33.68 (15.11) | 1081 14@O12 | 21174 402@H2 21172 402@O | 14.41 2.944 ( 0.25) 28.34 (14.35) | 3824 48@O26 | 21098 377@H1 21097 377@O | 13.70 3.002 ( 0.30) 31.00 (15.21) | 3845 48@O16 | 21156 396@H2 21154 396@O | 13.06 2.934 ( 0.26) 27.71 (14.05) . . .

There are total of about 40,000 lines.

I want to choose lines with the condition the digits in 3rd and 6th field fall in the range between 1-64 before the "@" symbol.

I have tried with the awk something like this code

awk '$3 ~ /^[0-9]/ && $6 ~ /^[0-9]/ {print}' hhHB_LL1000_D_lipid_A_water_001_064.tbl | head

解决方案

If I interpret your input correctly, these are the fields that should fall within the range [1-64]:

| 4645 58@O12 | 23489 1174@H1 23488 1174@O | 22.79 2.945 ( 0.28) 26.79 (14.41) ^ ^ _______| ______|

As far as I can tell, nothing in you're input that you have posted has this behavior...

Use this awk-script:

/^|/{ split($3, a, "@") split($6, b, "@") if(a[1] >= 1 && a[1] <= 64 && b[1] >=1 && b[1] <= 64) print }

If I add a a line to you're input:

| 3845 48@O16 | 21156 39@H2 21154 396@O | 13.06 2.934 ( 0.26) 27.71 (14.05) ^ ^ _______| ______|

This script outputs:

$ awk -f digits.awk digits.txt | 3845 48@O16 | 21156 39@H2 21154 396@O | 13.06 2.934 ( 0.26) 27.71 (14.05)