非法参考AWK数组（我有麻烦搞清楚AWK）

本文介绍了非法参考AWK数组（我有麻烦搞清楚AWK）的处理方法，对大家解决问题具有一定的参考价值，需要的朋友们下面随着小编来一起学习吧！ 问题描述

我想使用的脚本是：

cat gatk_probes.interval_list | awk ' BEGIN{ OFS="\t"; print "#CHR\tBP1\tBP2\tID" } { split($1,a,":"); chr=a[1]; if (match(chr,"chr")==0) { chr="chr"chr } split(a[2],b,"-"); bp1=b[1]; bp2=bp1; if (length(b) > 1) { bp2=b[2] } print chr,bp1,bp2,NR }' > ./EXOME.targets.reg

我收到错误：

awk: line 1: illegal reference to array b

有什么明显错误？

Is there something obviously wrong?

推荐答案

长度（B）是搞乱你，显然不是AWK的每一个执行支持它。你可以这样做，但：

length(b) is messing you up, apparently not every implementation of awk supports it. You can do this though:

BEGIN { OFS="\t"; print "#CHR\tBP1\tBP2\tID" } { split($1,a,":"); chr=a[1]; if (match(chr,"chr")==0) { chr="chr"chr } blength = split(a[2],b,"-"); bp1=b[1]; bp2=bp1; if (blength > 1) { bp2=b[2] } print chr,bp1,bp2,NR }

分裂返回数组中的元素（B在这种情况下）的数目。

split returns the number of elements in the array (b in this case).