测序揭示肺炎克雷伯氏菌高毒耐药原因

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测序揭示肺炎克雷伯氏菌高毒耐药原因

派森诺生物与河南农业大学杜向党教授团队合作，对4株新分离的具有多重耐药性和高毒力特性的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯氏菌（Carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae，CRKP）进行全基因组测序研究，成果以“Correspondence”的形式顺利发表在《柳叶刀》旗下子刊《The Lancet Infectious Diseases》（影响因子：25.071）！可喜可贺！

研究背景

2016年，《The Lancet Infectious Diseases》曾发表一篇流行病学研究论文，报道了一起由ST11型碳青霉烯类耐药高毒力肺炎克雷伯菌（ST11 CR-HvKP）感染引起的致命呼吸道相关肺炎流行病例。揭示了一个令人担忧的细菌演化现象——在碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯氏菌（CRKP）中同时存在由质粒介导的多重抗性和高毒力特性，这无疑是对肺炎克雷伯氏菌感染防控工作的巨大挑战。

基于此背景，河南农业大学研究人员做了一项调查碳青霉烯类耐药高毒力肺炎克雷伯菌（CR-HvKP）在中国的回溯研究（未发表）。在2011年至2016年间，研究人员分别从临床患者和动物体内分离了253株和102株肺炎克雷伯氏菌，并筛选碳青霉烯酶基因（blaOXA-48-liker，blaIMP，blaVIM，blaKPC和blaNDM）和毒力基因（rmpA， rmpA2，iucA，和iroN）。

测序平台：PacBio RS II&Illumina MiSeq

研究结果

从人类患者中分离出的四株CRKP菌株同时具有blaKPC-2，rmpA，rmpA2&#