安装IMvigor210CoreBiologies R包遇到的一系列问题

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安装IMvigor210CoreBiologies R包遇到的一系列问题

安装IMvigor210CoreBiologies R包遇到的一系列问题

IMvigor210CoreBiologies 是非常经典的免疫治疗队列的数据包，课题需要所以必须下载安装
官方给出的安装步骤已经过时了，参考生信技能树的安装步骤，首先安装了一堆依赖包。

list.of.packages <- c("shiny","tidyr",'tidyverse', "clusterProfiler","DT","ashr","enrichplot","plotly")all_packages = rownames(installed.packages())
save(all_packages,file = 'all_packages.Rdata')#checking missing packages from list
new.packages <- list.of.packages[!(list.of.packages %in% installed.packages()[,"Package"])]
new.packages 
packToInst <- setdiff(list.of.packages, installed.packages())
packToInst
if(T){lapply(packToInst, function(x){BiocManager::install(x,ask = F,update = F)})
}
lapply(intersect(packagesReq, installed.packages()),function(x){suppressPackageStartu