pythonbarcode碱基错配

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pythonbarcode碱基错配

扩增子测序不同于其他高通量测序项目，扩增子测序往往样品量较大，但单个样品的数据量要求不高(因为仅仅研究扩增区域的序列)。为了节约成本，研究者们通常会把多个样品混在一个文库，并给不同样品加上一段 Barcode 序列。在后续的生物信息分析中，根据 Barcode 序列即可将不同样品的序列拆分开来。接下来介绍两个序列拆分工具

seqtk_demultiplex 和 fastq-multx。

seqtk_demultiplex

seqtk_demultiplex 安装wget

# seqtk_demultiplex 要求GLIBC_2.14版本

wget .14.tar.gz

mv glibc-2.14.tar.gz /opt/sysoft

cd /opt/sysoft

tar zxvf glibc-2.14.tar.gz

cd glibc-2.14

mkdir build

cd build

../configure --prefix=/sysoft/glibc-2.14

make -j4

make install

cp /opt/sysoftglibc-2.14/lib/libc-2.14.so /lib64/

cd /lib64

mv libc.so.6 libc.so.6.back

# 报错不用管 error while loading shared libraries: libc.so.6: cannot open shared object file: No such file or direc