GO绘图问题

编程入门 行业动态 更新时间:2024-10-15 02:30:38

GO绘图问题

GO绘图问题

当进行GO绘图的时候

ego_CC <- enrichGO(gene = genes,
                   OrgDb=org.At.tair.db,
                   keyType = "TAIR",
                   ont = "CC",
                   pAdjustMethod = "BH",
                   minGSSize = 1,
                   pvalueCutoff = 0.5,
                   qvalueCutoff = 0.5,
                   readable = TRUE)

会出现以下问题

--> No gene can be mapped....
--> Expected input gene ID: AT1G24250,AT3G05210,AT3G22590,AT5G63110,AT3G01320,AT1G54360
--> return NULL...

解决方法

将所要进行绘图的那一列进行as.character转换

例如:

genes<-as.character(ID$genename)

然后再绘图就可以了

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本文发布于:2024-03-13 13:06:39,感谢您对本站的认可!
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