宏病毒组组学知识分享(一)

编程入门 行业动态 更新时间:2024-10-09 20:20:55

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宏病毒组组学知识分享(一)

 1. 宏病毒组简介   

        宏病毒组学 (Viral Metagenomics) :是在宏基因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支 ,是某类样本中所有病毒 (virus ) 或病毒类似物  (virus-like-particle ) 及其所携带遗传信息的总称。

       宏病毒组直接以环境中所有病毒的遗传物质 为研究对象,能够快速准确的鉴定出环境中所有的病毒组成,在病毒发现、病毒溯源、微生物 预警等研究方面具有重要作用。

2. 研究方法

       a.基于宏基因组数据,从中挖掘病毒信息;

       b.病毒颗粒富集后提取病毒核酸测序分析。 

3. 研究技术

组学技术主要研究对象样本类型推荐数据量(Gb)
病毒宏基因组DNA病毒土壤、水体、污泥、粪便、肠道内容物、动植物组织等土壤、水体、污泥、粪便、肠道内容物(15G);动植物组织(30G)
病毒宏转录组RNA病毒
病毒组全谱DNA&RNA病毒

4. 技术优势

       a. 方案多样化:根据客户的样本类型及研究目的,设计有针对性的实验方案和分析方案

       b. 病毒鉴定准确: 自主研发组装注释软件,可提高鉴定到的病毒数量及准确度

       c. 病毒定量准确:无 PCR 重复性,降低定量误差

       d. 分析内容全面:一套数据,多种分析用途 (细菌、真菌及病毒)

       e. 病毒检出率高:同样测序深度下,分析得到的病毒种类更加丰富

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