fortran与python跨语言集成(f2py/gfortran)

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fortran与python跨语言集成(f2py/gfortran)

于2021年9月4日进行第一次更新，优化了文章结构和解决方案内容。

目录

• 一、引言
• • 运行环境
  • 问题描述
• 二、解决方案
• • 示例代码
  • 方案一：F2Py
  • • 编译方式
    • 调用方式
  • 方案二：gfortran
  • • 1. 生成exe文件：
    • 2. 生成dll文件：
    • 调用方式
• 三、遇到问题及建议
• • 遇到的问题
  • 建议
• 参考文献

一、引言

运行环境

问题描述

软件开发项目，界面使用Python开发，基于性能和资源丰富程度考虑，数值计算部分用Fotran语言实现，然后通过Python调用，其中Fortran代码版本较杂，f77、f90、f95同时共存。

二、解决方案

目前有如下两种解决方案，由于项目时间较为紧张，最终暂采用了F2Py方案：

1. 利用F2Py将Fortran代码编译为pyd格式，在Python中可以直接作为模块import。针对简单代码很容易搞定，Fortran代码内容较多较复杂时，需遵守一定编写规范（见建议）；
2. 利用gfortran或intel的编译工具，将Fortran代码编译为dll文件，在Python中借用ctypes进行加载并调用。针对简单代码较为有效，面对复杂代码时，报错较多。

示例代码

hello_subroutine.f90

subroutine helloprint *,'hello world'
end subroutine hello

hello_program.f90

program mainimplicit noneprint *, 'Hello World'
end program main

方案一：F2Py

具体信息见官网：F2PY - Calling Fortran routines from Python

编译方式

python2下：
python -m numpy.f2py -c hello_subroutine.f90 -m hello_subroutine 建议这种方式
or f2py -c hello_subroutine.f90 -m hello_subroutine
python3下
python3 -m numpy.f2py -c hello_subroutine.f90 -m hello_subroutine 建议这种方式
or f2py3 -c hello_subroutine.f90 -m hello_subroutine
编译后会生成hello_subroutine.pyd文件

调用方式

from hello_subroutine import hello  # 需注意路径问题
print(hello())

方案二：gfortran

首先需自行配置minGW64，网上资料较多，按照说明配置好环境变量，在dos窗口中输入gfortran --version能够输出其版本信息则说明安装成功。

1. 生成exe文件：

gfortran -o hello_program hello_program.f90
运行：./hello_program.exe
需要注意的是，若用这种方式编译hello_subroutine.f90，则会报错

D:/software/mingw64/bin/../lib/gcc/x86_64-w64-mingw32/8.1.0/../../../../x86_64-w64-mingw32/lib/../lib/libmingw32.a(lib64_libmingw32_a-crt0_c.o):crt0_c.c:(.text.startup+0x2e): undefined reference to `WinMain'
collect2.exe: error: ld returned 1 exit status

2. 生成dll文件：

1. gfortran -shared -fPIC -o hello_subroutine.dll hello_subroutine.f90 —— 编译后，引用其中函数时，需在函数名称后添加_，eq：hello_
2. gfortran -shared -fPIC -g -o hello_subroutine.dll hello_subroutine.f90 -fno-underscoring —— 可直接引用原函数名

调用方式

from ctypes import cdll, windll, CDLL, WinDLL
dllpath = 'hello_subroutine.dll'
dll1 = cdll.LoadLibrary(dllpath)  # cdll是CDLL类的对象
dll2 = windll.LoadLibrary(dllpath)  # windll是WinDLL类的对象
dll3 = CDLL(dllpath)
dll4 = WinDLL(dllpath)
dll1.hello_()  # 针对于方式1）
dll1.hello()  # 针对于方式2）

三、遇到问题及建议

遇到的问题

1. D:/software/mingw64/bin/../lib/gcc/x86_64-w64-mingw32/8.1.0/../../../../x86_64-w64-mingw32/lib/../lib/libmingw32.a(lib64_libmingw32_a-crt0_c.o):crt0_c.c:(.text.startup+0x2e): undefined reference to `WinMain' collect2.exe: error: ld returned 1 exit status
   已在上面说明
2. OSError: exception: access violation reading 0x0000000000007530
   暂未解决，待补充。

建议

1. 接口函数中的参数，不得使用allocate定义，若输入参数确实需为变长，可同时将参数大小作为单独的参数传入，然后在Fortran代码中创建该参数；
2. 接口函数中的参数，建议明确使用intent(in)、intent(out)、intent(iinout)指定，其中in表示只作为输入参数，不可对其进行修改；out表示作为返回参数，将数据传递回Python；inout表示同时作为输入参数和返回参数，可以对其进行修改；
3. 不建议使用module进行传参；
4. 建议统一Fortran代码版本，最好是f90以上版本。

参考文献

[1] F2PY - Calling Fortran routines from Python
[2] call functions from a shared fortran library in python
[3] creating DLL with gfortran on Windows
[4] …

以上，欢迎补充&交流。