安装LSF

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安装LSF

安装需求

• 基本硬件配置建议：
  • CPU  4核或以上（LSF 没有最低 CPU 需求，此处只是建议）
  • 内存  8G或以上（ 当没有作业在运行时， Linux x86-64 上集群中的 LSF 守护程序将使用大约 488 MB 内存。）
  • 交换空间通常配置为物理内存的两倍
  • 节点硬件资源的高低，取决于集群运行作业的多少、作业类型（偏向于CPU、还是偏向于内存） 
  • LSF管理节点的配置要求，可以参考官方说明：Management host selection
• 操作系统要求: 官方正式支持的各种系统，常用为Linux系统。
• 配置共享存储。
• 用户统一管理, 提前设置好LSF管理用户（lsfadmin或者一个普通用户）。
• 集群需要时间同步。
• root用户可以免密从管理节点到其他节点运行ssh。 节点之间要求双向解析主机和IP。

环境说明

本示例中的IP规划如下：

主机名	LSF集群相关服务	IP
lsf-master1	LSF管理节点	192.168.75.154
lsf-master2	LSF候选管理节点	192.168.75.155
compute	LSF计算节点	192.168.75.156

配置安装LSF前的相关服务

域名解析

保证计算节点之间能正常解析和反解析IP/hostname。

本示例中为配置本地域名解析，修改每个节点中的/etc/hosts文件，操作如下：

# tail -3 /etc/hosts
192.168.75.154 lsf-master1
192.168.75.155 lsf-master2
192.168.75.156 compute

配置ssh免密登录

root用户能够从管理节点通过ssh无密码访问新节点，方便从管理节点在新节点远程启动LSF。如果是有密码访问，机器少还可以输入密码，但是大的集群还是配置无密码访问效率更高。

免密设置可参考如下操作：

[root@lsf-master1 ~]# ssh-keygen 
Generating public/private rsa key pair.
Enter file in which to save the key (/root/.ssh/id_rsa): 
Created directory '/root/.ssh'.
Enter passphrase (empty for no passphrase): 
Enter same passphrase again: 
Your identification has been saved in /root/.ssh/id_rsa.
Your public key has been saved in /root/.ssh/id_rsa.pub.
The key fingerprint is:
SHA256:4K+YpiQOAFK7E1oDsOq1iNOofqea4vlUmkcm65F7St8 root@lsf-master1
The key's randomart image is:
+---[RSA 2048]----+
|+ .              |
| + .             |
|+ =   .          |
|+o + . .         |
|+ oo +. S        |
|+oo.@  .         |
|*ooX .  .        |
|=+*.*=..         |
|=B=OB..E         |
+----[SHA256]-----+
[root@lsf-master1 ~]# ssh-copy-id root@lsf-master2
......
root@lsf-master2's password:        # 此处输入lsf-master2密码
[root@lsf-master1 ~]# ssh-copy-id root@compute
......
root@compute's password:            # 此处输入compute密码

时间同步

确保每个节点时间相同，防止认证失败。

请确认集群各节点时间服务器是否一致，可以查看/etc/chrony.conf文件。参考如下：

# grep server /etc/chrony.conf 
server xx.xx.xx.xx prefer iburst minpoll 4 maxpoll 4

配置NFS挂载

LSF安装在共享存储上，每个计算节点挂载即可使用，无需再次安装。

(1)设置共享目录

[root@lsf-master1 ~]# mkdir  /tools/[root@lsf-master1 ~]# echo "/tools/ *(rw,sync,no_root_squash)" >> /etc/exports

(2)启动rpcbind服务，并设置开机启动

[root@lsf-master1 ~]# systemctl enable rpcbind --now

(3)启动nfs服务，并设置开机启动

[root@lsf-master1 ~]# systemctl restart nfs-server

(4)查看挂载状态

[root@lsf-master1 ~]# showmount -e localhostExport list for localhost:/tools/ *

账户管理

可以使用OpenLDAP/NIS来统一管理用户，保证同一个用户在每个节点上有相同的UID。

本示例中为便捷操作，使用useradd、groupadd创建UID、GID一致的管理员账户。步骤参考如下所示：

(1)创建集群管理组

groupadd -g 2001 lsf

(2)创建集群管理用户

useradd -u 2000  -G lsf  lsfadmin

安装LSF

lsf-master节点解压修改配置

(1)进入LSF安装包所在的位置。

(2)解压 lsfsce10.2.0.12-x86_64.tar.gz

[root@lsf-master1 ~]# cd /tmp[root@lsf-master1 tmp]# ls lsfsce10.2.0.12-x86_64.tar.gzlsfsce10.2.0.12-x86_64.tar.gz[root@lsf-master1 tmp]# tar -xf lsfsce10.2.0.12-x86_64.tar.gz[root@lsf-master1 tmp]# ls lsfsce10.2.0.12-x86_64/lsf/lsf10.1_linux2.6-glibc2.3-x86_64.tar.Z      # LSF运行时使用的包lsf10.1_lsfinstall_linux_x86_64.tar.Z       # 安装引导包

(3)解压lsf10.1_lsfinstall_linux_x86_64.tar.Z

[root@lsf-master1 tmp]# cd lsfsce10.2.0.12-x86_64/lsf/[root@lsf-master1 lsf]# tar xzf lsf10.1_lsfinstall_linux_x86_64.tar.Z[root@lsf-master1 lsf]# lslsf10.1_linux2.6-glibc2.3-x86_64.tar.Z  lsf10.1_lsfinstall  lsf10.1_lsfinstall_linux_x86_64.tar.Z[root@lsf-master1 lsf]# cd lsf10.1_lsfinstall/[root@lsf-master1 lsf10.1_lsfinstall]#

(4)编辑安装配置文件

[root@lsf-master1 lsf10.1_lsfinstall]# vim install.config# 设置安装路径LSF_TOP="/tools/lsf"     # 设置管理员账号，以实际管理员名称为准LSF_ADMINS="lsfadmin"   # 设置集群名称LSF_CLUSTER_NAME="cluster1"   # master机器列表，如果有多台机器，建议设置两台master，作为冗余备份LSF_MASTER_LIST="lsf-master1 lsf-master2"   # 指定安装文件lsf10.1_linux2.6-glibc2.3-x86_64.tar.Z路径LSF_TARDIR="/tmp/lsfsce10.2.0.12-x86_64/lsf"  # 添加计算机节点机器，也可以安装后配置LSF_ADD_SERVERS="lsf-master1 lsf-master2 compute"  # 添加客户机（投递机）节点，也可以安装后配置#LSF_ADD_CLIENTS=""     

LSF安装

(1)安装lsf集群需要的安装包，根据系统版本不同可能会缺少依赖，需要的依赖安装过程中会在页面显示。通过root用户来安装。

[root@lsf-master1 lsf10.1_lsfinstall]# yum -y install  java  nfs-utils java-openjdk ed[root@lsf-master1 lsf10.1_lsfinstall]# ./lsfinstall -f install.config

(2)配置系统开机自启方式

[root@lsf-master1 lsf10.1_lsfinstall]# /tools/lsf/10.1/install/hostsetup --top="/tools/lsf" --profile="y" --boot="y"[root@lsf-master1 ~]# systemctl enable lsfd --now

(3)查看LSF环境变量

[root@lsf-master1 lsf10.1_lsfinstall]# . /tools/lsf/conf/profile.lsf[root@lsf-master1 lsf10.1_lsfinstall]# env | grep lsfMANPATH=/tools/lsf/10.1/man:HOSTNAME=lsf-master1LSF_SERVERDIR=/tools/lsf/10.1/linux2.6-glibc2.3-x86_64/etcOLDPWD=/root/lsfsce10.2.0.12-x86_64/lsfLSF_LIBDIR=/tools/lsf/10.1/linux2.6-glibc2.3-x86_64/libLD_LIBRARY_PATH=/tools/lsf/10.1/linux2.6-glibc2.3-x86_64/libPATH=/tools/lsf/10.1/linux2.6-glibc2.3-x86_64/etc:/tools/lsf/10.1/linux2.6-glibc2.3-x86_64/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/root/binPWD=/root/lsfsce10.2.0.12-x86_64/lsf/lsf10.1_lsfinstallLSF_BINDIR=/tools/lsf/10.1/linux2.6-glibc2.3-x86_64/binLSF_ENVDIR=/tools/lsf/conf

LSF启动

在计算节点挂载共享存储：

# mkdir /tools# echo "192.168.75.159:/tools /tools nfs defaults 0 0" >> /etc/fstab# mount -a# df -hT | grep /tools172.31.27.152:/tools nfs4       20G  8.0G   12G  41% /tools# su - lsfadmin# . /tools/lsf/conf/profile.lsf

在lsf.conf文件中添加如下内容：

LSF_RSH=ssh

启动（用root用户操作）：

# lsfstartup

验证（用普通用户操作）：

$ lsload
$ bhosts