linux中grep一些实用技巧

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linux中grep一些实用技巧

第一种高级用法：精确匹配
有时候，我们需要在文本中查找一个确切的单词或短语，而不是仅仅匹配一个字符串的一部分。这时，grep命令的 -w 选项就派上用场了。它会精确匹配整个单词，而非单词的一部分。就像是在一篇文章中找到你想要的句子，而不是零散的单词。

[2020200461@login01 Ta_shellscripts]$ less Song_transcriptome.fa | grep -w TraesCS1A03G0248200.1
>TraesCS1A03G0248200.1

第二种高级用法：忽略大小写

[2020200461@login01 Ta_shellscripts]$ less Song_transcriptome.fa | grep -i traesCS1A03G0248200.1
>TraesCS1A03G0248200.1

第三种高级用法：反向匹配

grep -v

第四种高级用法：行号显示

grep -n

第五种高级用法：显示匹配上下文

>TraesCS7B03G0207400.1
AACGGGCCGGGTGGCCGGAACAACAAACCCGTGTGCCCGGCGCGCGCCAACGGCTAGGCGAGGGCCGGCCACCCCGTTCCGTTCCACGCGATCTGCGCTACCAGCTCGAATACAAAATATCGAAATTGTTCGGTTTAAAATGGCACGTCCCCTGCTTGTTCTGCTTCACTTGTCCTGCGCCAGCACCGCGCTCCAGGTCACAAGCTCGACCTCGCAGAGCGCGCCCGCCGCCGGAATGGCTTCCAGCGCCGCCGCCGACGTGGTTGAGACCGAGCTGCTCCCGTTCATCCGCGTGTACAAGAGCGGCCGCGTCGAGCGCCTGCTCGGCACCGACACCGTGCCGGCGTCCTTCGACGCGCCCACGGGCGTGGCGTCCAAGGACGTCGTCATCGACCCGGCCACCGGCGTCTCCGTCCGCCTCTACCTTCCGCCAGCGGCTGCGGCATCCGGGGGCGAAGGCAAGAAGCTGCCCGTCCTCGTGTACTTCCACGGCGGCGGGTTCATGGTCGAGACGGCGGCCTCCCCGACGTACCACCGCTACCTGAACGCGCTCGCCGCCCACGCGGGCGTCCTCGCGGTGTCCGTGGAGTACCGCCGCGTGCCGGAGCACCCGCTCCCCGCGGCCTACGACGACTCCTGGGCGGCCCTCGCGTGGGCGGTCGCCGGCACCGCCCCGGGATGCCCCGAGCCGTGGCTCGCGGCGCACGGGGACGCGTCCCGCGTGTTCCTCGCCGGCGACAGCGCGGGCGCCAACATCGCGCACAACGTCGCCCTGCGCGCCGCCGCCGAGGGGCTCCCGCGCCCGTGCGCGGCCATCGTCGGCGTGCTGCTGGTGCACCCCTACTTCTGGGACCCGACCAACGCCATGACGCCCGCTCTGGAGGTCAGGATCCGCCGCGAGTGGCGGTTCATGTGCGCGCGCCCCGACGCCGAGGTCGACGACCCGAGGTTCTGCCCGACGTGCGCCGAGGCGGCGCCGCTGCTCGCGGCGCTGCCGTGCAAGAGGGCGATGCTGGCCGTGGCGGGCGACGACTTCCTGGCGGTGAAGGGGCGGGCGTACTACGCGGCGCTGCTCGCGAGCGGGTGGCGCGGCGAGGCCGAGCTGGTGGACACGCCGGGGCAGGACCACGTGTTCCATCTCATGCGGCCGGGGACGGAGGCGGCCGCCGAGATGTTGGACCGCGTCGCGGGTTTCATTTCTCGTGCTTGACCTCACCTGCTCCCCGTCTTGCGTCAGGGCGGCTAATAAATGAAGCAGACTCGCTATCTCCCAAGAGCGTTTTGAAGTCTCCTCTCGGAATTTTGCTATACATCTGTGCTGCACCCATCGGCGCCCCCCGTGACAAGTCCAACACAGTGGGAGCTCAATGAGAGAGGCGTTTTGAGGGCCGAGCTCCATGGAGGCCTTTATTTTTGAAAAATTCAAATTCAAACTTTTATGGTTCAAAAAATTCTAAAAAAATATGCGTG
>TraesCS1A03G0248200.1
ATGGCGAGCAGCGGCGAGGTGCAGAGATCGCTGCAGGCGGTGGCGCAGGGGCTGCGGTGGACGTACGCCCTCCTCTGGCAACTCTGCCCCGACCAAGGAGCGCTGGTGTGGGCGGAGGGGCACTACAACGGCGCCATCAAGACGCGCAAGACGGTGCAGCCGGCCGTTGCCCAGGCGCAGGTACCGGCGCCGGCGGCGGAGGCAGCCGACCAGGCCCGGAGCCGGCAGCTGCGGGAGCTGTTCGACTCGCTGGCCAGGGAGGCTGCCGCGGGCGGCGGGACAGGCTTCAGGGACGTCCACGGCTGCGCCCAGGAGGCTCGGCGGCCCAGCGCGGCGCTGGCTCCGGAAGACCTGACGGAGACGGAGTGGTTCTATCTCATGTCTGCCTCTTACTCCTTCCCTCCCGGCGTCGGGTTACCTGGAAGGGCCTTTGCAAGGGGAGGGCACGTATGGCTTAGTAGAGCAAATGAAGTTGACAGCAAGGCATTCTCAAGAGCAATACTTGCCAGGAGTGCAGGAATCAAGACGGTCGTATGCATTCCGATTGTCGATGGTGTCCTAGAAATCGGGACCACAGAAAAGGTGGAGGAAGACATGGGTTTGGTCCAGTATGCAATGGCCATCTTCATGGATCAACAAGAAACCCACATGATCTCTAGCATCTGCCATTCCAACCAAACCAGCCACATTGACCAACAGTCATTCCAAACGCAGAGGAAGACACCCACTGGTCAGCCAAAGCCGGAGCCAAACAAGTTCAACCCAGAATACGAGGACGATGAAATGGAGTACGACGACGACGAGATCGATGCAGAGTGCGCGTCGGGTTCAGCAAGCCATGATGATCATACAACACATAATGCAGGGAGCAGCGAGCTGATGCAGGTTGAGACGTCAGAGAGGGTGAGAGATGGCTGCTCAAGCAACTTTGGTGATGAGATCCAAATGCTGATGGTTTGCCAGAACAGCACTGATGATCATTCCAATTTGCATGGGCAAAATGAAGCTTGGCATTTTCTCTACGAGGAGCTATGCAGTGGCTACCCTCAATCGTCAGGTGAGAACCAAGCAATGGCTGAAAATGCTCACTACGCACAGACACTCTCGTTGATCCTGCATCGCAACAACGCCCTGAGACAGGGCGGCGGCCTGAACACCGGGTCCTACCTGGCAGTCTCACTCCAATCTTCATTCTCCAGATGGGATGCTGGCATCCATGGACGCACGGTCGCCCAAGGCACCACCCGGCAGAAGATGCTCAAGAGTGTCCTCCTGTTCTTCAGTGCTGCCTGCAACAAGCCACCGGGCGATCCGAGGTGCGACGATGCCGGCGCGCGGAGGGAGGTCGACTTCGGCGCCAGCCATGTCATGCAGGAGCGGAAGAGAAGGGAGAAGCTCAACGAGCGGTTCATCGTCCTGCGGTCCCTGGTGCCCTTCGTCACCAAGATGGACAAGGCCTCGATCCTCGGCGACACGATCGAGTACGTGAAGCAGCTGACGAAACGCATCCAGGACCTTGAATCATCGACGGTCAGGGGGCCGGCGATGTCGAAAGAGAAGCGTGCGCTGCCGACGGGCATGGAAGGGGCCAGCAGCAGCAGCGGCAGCACCCCTGTGGCCACGGACGTGCAGGTCTCCATCATCGAGAGCGACGCGTTGCTGGAGCTCCGGTGCCCCGACACGCACGGCCTGCTGGTGACCATCATGCAGACGCTCCAGGAGCAGCTCCGGCTCGAGGTCACCTCCGTCCAGGCGTCGTCGGACCACGGCGTGCTGCTCGCCGAACTGCGCGCCAAGGTGAGGGAGGTGCATGGGAGGAGGAGCAGCATTTCTCAAGTGAAGAGAGCGATCCATCTCATCATCTCATCAGGATGAGTGGATGTGCAACAGATTAGTAGTAGCATATGTCATCAGCCTCCCCCTTGATGCTTATGTGTCGATAAAAAGCACCCTTTGTCGAAAAATTTCATCAGGCTTTGTTTTTTTTGTTAGCCTCTGTTCATACATATCAACACTAATGATAATG
>TraesCS5A03G0381200.1

第六种高级用法：统计匹配行数

grep -c