总是跑数据，却对数据一无所知，这说不过去吧。
看几篇文章吧
Sequencing depth and coverage: key considerations in genomic analyses（只讲二代）
Assembly of large genomes using second-generation sequencing（参考文献）
Identification of optimum sequencing depth especially for de novo genome assembly of small genomes using next generation sequencing data（二代最佳测序深度：50X）
Large Genome Assembly with PacBio Long Reads（已更新）（纯三代最少50X，二三代联合：任意深度，策略不同）
回答几个问题：
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测序深度和覆盖度（Sequencing depth and coverage）
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