upset图形如何理解

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upset图形如何理解

upsetR是除了韦恩图之外另一种集合可视化的方法。一般集合不超过5个的时候，可视化效果还是不错的，但是集合超过五个时，你就很难从图中解读出想要的信息了。

这是我们可以使用upsetR包来进行处理。

upset图要结合柱子和点一起来看。

首先我们导入的数据为list <- list(Heart=rownames(subset(d1, group=='Network')), Muscle=rownames(subset(d2, group=='Network')), Lung=rownames(subset(d3, group=='Network'))) 里面是不同器官的基因，而这三个器官的基因之中会有交集。

第一个柱子，点在heart那行，表明该柱子表示只属于heart的基因数量。

 所以是1107

第二个柱子，点在muscle那行，表明该柱子表示只属于muscle的基因数量。

所以是483

第三个柱子，点在muscle和heart两行，表明该柱子表示muscle和heart交集中的基因数量（但不包括muscle，heart，lung三个交集中的基因）。

所以是399

第六个柱子，点在muscle和heart，lung三行，表明该柱子表示muscle和heart，lung交集中的基因数量。

所以是中间的交集105个

即：点在哪些集合的那行，上面的柱子就表示两几个集合的交集。（只有那几个交集的部分）