区别一：linux区分大小写，windows在dos界面命令下不区分大小写；
区别二：文件系统区别
- windows下的文件系统
在 Windows 下，打开 “计算机”，我们看到的是一个个的驱动器盘符：
每个驱动器都有自己的根目录结构，这样形成了多个树并列的情形，如图所示：
- Linux下的文件系统
在 Linux 下，我们是看不到这些驱动器盘符，我们看到的是文件夹（目录）：
linux没有盘符这个概念，只有一个根目录 /，所有文件都在它下面
Centos的文件结构
- /bin 可执行二进制文件的目录，如常用的命令 ls、tar、mv、cat 等
- /home 普通用户的家目录
- /root root用户的家目录
- /boot 内核文件的引导目录, 放置 linux 系统启动时用到的一些文件
- /sbing 超级用户使用的指令文件
- /tmp 临时文件目录,一般用户或正在执行的程序临时存放文件的目录，任何人都可以访问，重要数据不可放置在此目录下。
- /dev 设备文件目录 万物皆文件
- /lib 共享库，系统使用的函数库的目录，程序在执行过程中，需要调用
一些额外的参数时需要函数库的协助。
- /usr 第三方 程序目录
- /etc 配置程序目录，系统配置文件存放的目录
- /var 可变文件，放置系统执行过程中经常变化的文件
- /opt 用户使用目录，给主机额外安装软件所摆放的目录。
区别三：linux所有内容均以文件形式保存包括硬件，用户，而windows文件和硬件没什么关系，两个之间没有关联；
区别四：windows用扩展名区分文件如.exe代表执行文件，.txt代表文本文件，而linux无扩展名的概念，当然为了管理员区分方便会有部分扩展，
例如.gz ， .bz2 ，.tar.bz2代表压缩包，.html ，.php代表网页文件，这些纯粹是给管理员看的便于区分，但是linux本身是没有扩展名的，linux是以权限区分文件的，文件权限总共有十位（可用ls -l查看每个文件的权限）。
区别五：
windows平台:数量和质量的优势，不过大部分为收费软件；由微软官方提供重要支持和服务 。
linux平台：大都为开源自由软件，用户可以修改定制和再发布，由于基本免费没有资金支持，部分软件质量和体验欠缺；有全球所有的Linux开发者和自由软件社区提供支持。
区别六：
windows下的.exe文件不能直接在linux下安装与运行，同时linux大部分是字符界面，大大增加了linux系统的安全性，减少了木马攻击的可能性，同时linux字符界面占用的系统资源要小于windows下的图形界面所占的资源。
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